Το εργαστήριο Μικροχημείας

  • Συνεχίζοντας τη προσφορά προϊόντων και υπηρεσιών ποιότητας
  • Αναγγέλλει την έναρξη μίας καινούργιας υπηρεσίας που θα απελευθερώσει χρόνο και πόρους σε όσους ασχολούνται με τη Μοριακή Βιολογία σε όλων των ειδών τις εφαρμογές.

Προσφέρουμε

  • Ανάγνωση Αλληλουχιών δίκλωνου DNA.
  • Ανάγνωση Αλληλουχιών μονόκλωνου DNA.
  • Ανάγνωση Αλληλουχιών προϊόντων PCR.
  • Απλό πέρασμα επέκτασης συγκεκριμένου εκκινητή (primer).
  • Τακτικές αναφορές προόδου για τις μεγαλύτερες εργασίες.
  • Συλλογή, μεταφορά και βασική επεξεργασία των δεδομένων
  • Σχεδιασμό της στρατηγικής για την ανάγνωση των αλληλουχιών.
  • Επιστημονική και τεχνική υποστήριξη για όλα τα σχετικά με την Ανάγνωση Αλληλουχιών θέματα.

Εγγυώμεθα

  • Τον υψηλότερο βαθμό ακρίβειας
  • Την ανάγνωση 2kb σε τέσσερις εβδομάδες
  • Πλήρη Εχεμύθεια.

Πρόσθετες Υπηρεσίες

  • Χρήση χωρίς χρέωση, των εκκινητών του εργαστηρίου μας.
  • Δυνατότητα σχεδιασμού και σύνθεσης νέων εκκινητών (primers),
  • Εξειδικευμένη επεξεργασία των δεδομένων
  • Αναζητήσεις σε βάσεις δεδομένων
Επικοινωνία:      Ειρήνη Στρατιδάκη, Εργαστήριο Μικροχημείας
Ίδρυμα Τεχνολογίας και Έρευνας Τ.Θ. 1527
711 10 Ηράκλειο Κρήτη
Τηλέφωνο: +30 81 391150
Fax: +30 81 391151
Ε-mail: stratida@nefeli.imbb.forth.gr

Χρήσιμες Πληροφορίες

Διαθέτουμε μία σειρά από σημασμένους εκκινητές "primers", πίνακας 1 και έχουμε την δυνατότητα να σχεδιάσουμε, να συνθέσουμε και να σημάνουμε οποιοδήποτε εκκινητή χρειαστεί.

Πίνακας 1. Διαθέσιμοι, χωρίς χρέωση, εκκινητές για την ανάγνωση αλληλουχιών DNA
Εκινητής
(primer)		 Αλληλουχία Μέγεθος
(βάσεις)		 MW
(g/mole)
KS 5’-(Cy5)CGA GGT CGA CGG TAT CG-3’ 17 5249
SP6 5’-(Cy5)GAT TTA GGT GAC ACT ATA G-3’ 19 5864
SK 5’-(Cy5)GCT CTA GCT CTA GAA CTA GTG-3’ 21 5497
(RP)-OPM 5’-(Cy5)GGA ATT GTG AGC GGA TAA CA-3’ 20 6227
T3 5’-(Cy5)ATT AAC CCT CAC TAA AGG G-3’ 19 5778
T7 5’-(Cy5)AAT ACG ACT CAC TAT AGG G-3’ 19 5818
(UP)-20 5’-(Cy5)GTA AAA CGA CGG CCA GTG-3’ 18 5555
(UP)-OPTI 5’-(Cy5)GGT AAC GCC AGG GTT TTC C-3’ 19 5817
RP 5’-(Cy5)GAA ACA GCT ATG ACC ATG-3’ 18 5514
PBR-322F 5’(Cy5) GTA TCA CGA GGC CCT-3’ 15 4550
PBR-322R 5’(Cy5) GAT AAG CTG TCA AAC-3’ 15 4583
T7TERM 5’(Cy5) GCT AGT TAT TGC TCA GCG-3’ 18 5501

Οδηγίες σχεδιασμού εκκινητών.

Εάν επιλέξετε να σχεδιάσετε και να παραγγείλετε τους εκκινητές χωριστά, ακολουθήστε τους παρακάτω κανόνες για το σχεδιασμό τους.

  • Μήκος μεταξύ 18 και 25 βάσεων
  • Tm πάνω από 500 C
  • Η αλληλουχία του primer πρέπει να ακολουθείται από ένα Α η C στη θέση +1 προς το 3’ άκρο
  • Να υπάρχει ισοκατανομή των βάσεων και αν είναι δυνατόν 6C
  • Oχι εσωτερικές επαναλήψεις , αποφυγή διμερών
  • Οι εκκινητές θα πρέπει να αποστέλλονται μαζί με το DNA σε συγκέντρωση 300 ng/μl, 2μl ανά αντίδραση

Ποιότητα και ποσότητα DNA

Υπάρχει σαφέστατη συσχέτιση μεταξύ ποιότητας και ποσότητας DNA με το μέγεθος και την ακρίβεια διαβάσματος . Το DNA πρέπει να είναι ομοιογενές καθαρό απαλλαγμένο από πρωτεΐνες τυχόν νουκλεοτίδια και άλατα διαλυτοποιημένο σε dH2O (όχι σε ΤΕ γιατί αναστέλλεται η δράση της πολυμεράσης) . Καθαρισμός με εμπορικά διαθέσιμες κολώνες όπως Qiagen κ.λ.π δίνουν ικανοποιητικό αποτέλεσμα.

Χαμηλή συγκέντρωση DNA έχει σαν αποτέλεσμα αδύνατο σήμα και μικρότερο διάβασμα . Για cycle sequencing με σημασμένο primer 1-2 μg ανά αντίδραση είναι αρκετό . Για εσωτερική σήμανση με μη σημασμένο primer χρειαζόμαστε 5-10 μg ανά αντίδραση.

Αναλυτικός Κατάλογος Υπηρεσιών Ανάγνωσης Αλληλουχιών DNA

1) ΑΠΛΗ ΑΝΑΓΝΩΣΗ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΑΣ( ποιότητα αρχικής εκτίμησης )
Εφαρμογή - Έλεγχος κλωνοποιημένου DNA , και PCR fragments
Παρεχόμενη υπηρεσία- Διάβασμα έως 300 βάσεις με χρήση σημασμένου primer από το πίνακα 1.
Χρειαζόμαστε - DNA 1μg /αντίδραση ανάγνωσης συγκέντρωσης 1μg/10μl dH2O, ομοιογενές καθαρισμένο από κολώνα (Qiagen κ.λ.π), επίσης πληροφορίες σχετικές με είδος vector, θέση κλωνοποίησης, μέγεθος insert
Παίρνετε - Το χρωματογράφημα


2) ΑΝΑΓΝΩΣΗ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΑΣ ΣΕ ΜΟΝΗ ΑΛΥΣΙΔΑ
Εφαρμογή - Επιβεβαίωση αλληλουχίας, σύγκριση αλληλουχιών κ.λ.π
Παρεχόμενη υπηρεσία- Διάβασμα της μιας αλυσίδας DNA με συνδυασμό διαφόρων τεχνικών (σημασμένων primers , primer walking) και ένζυμων (Taq η Τ7 DNA Polymerase ) Η χρησιμοποίηση οποιουδήποτε primer δεν χρεώνεται επιπλέον. Πιστότητα διαβάσματος 99%.
Χρειαζόμαστε - Ομοιογενές καθαρισμένο από κολώνα (Qiagen κ.λ.π)DNA διαλυτοποιημένο σε dH2O. Η ποσότητα που απαιτείται εξαρτάται από το μέγεθος του DNA, επίσης πληροφορίες σχετικές με είδος vector, θέση κλωνοποίησης, μέγεθος insert και φωτογραφία ηλεκτροφόρησης όπου φαίνεται η ποιότητα και η ποσότητα του DNA.
Παίρνετε - Την αλληλουχία όπως προκύπτει από την ανάγνωση της μιας αλυσίδας στη σειρά (οι αμφίβολες βάσεις είναι γραμμένες με μικρότερα γράμματα) , σύγκριση αλληλουχίας με τυχόν γνωστή , γραπτή αναφορά , μεταφορά δεδομένων


3) ΑΝΑΓΝΩΣΗ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΑΣ ΚΑΙ ΣΤΙΣ ΔΥΟ ΑΛΥΣΙΔΕΣ (ποιότητα δημοσίευσης)
Εφαρμογή - Δημοσίευση , αίτηση πατέντας , κατάθεση σε βάση δεδομένων, διάγνωση κ.λ.π
Παρεχόμενη υπηρεσία- Διάβασμα και των δυο αλυσίδων DNA με συνδυασμό διαφόρων τεχνικών (σημασμένων primers , primer walking) και ένζυμων (Taq η Τ7 DNA Polymerase ) . Τυχόν επιπλέον στάδια υποκλωνοποιήσεων γίνονται από τους ενδιαφερόμενους. Πιστότητα διαβάσματος 99,9%.
Χρειαζόμαστε - Ομοιογενές καθαρισμένο από κολώνα (Qiagen κ.λ.π)DNA διαλυτοποιημένο σε dH2O, επίσης πληροφορίες σχετικές με είδος vector, θέση κλωνοποίησης, μέγεθος insert και φωτογραφία ηλεκτροφόρησης όπου φαίνεται η ποιότητα και η ποσότητα του DNA.
Παίρνετε - Την αλληλουχία όπως προκύπτει από την ανάγνωση και των δυο αλυσίδων στη σειρά (οι αμφίβολες βάσεις διευκρινίζονται με επιπλέον διαβάσματα), γραπτή αναφορά , μεταφορά δεδομένων


4) ΔΙΑΘΕΣΙΜΕΣ ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑΤΙΚΕΣ ΥΠΗΡΕΣΙΕΣ
Μεταφορά - Μεταφορά δεδομένων ηλεκτρονική, Δισκέτα, email
Εκκινητές - Σχεδιασμός, Σύνθεση
Επεξεργασία δεδομένων - Αναζήτηση σε βάσεις δεδομένων (Genbank, EMBL)
Διερεύνηση ενδιαφερουσών αλληλουχιών (π.χ. Θέσεις δράσης περιοριστικών ενζύμων)


Γενικά | Παραγγελία | Επικοινωνία
Αρχική Σελίδα | Δομή του Site